La espectrometría de masas es una técnica analítica esencial en el contexto de la proteómica debido a su alta capacidad de análisis, su sensibilidad y su precisión en la determinación de las masas moleculares de péptidos y proteínas, así como los espectros de fragmentación que proporcionan información de secuencia. La identificación de péptidos y proteínas en mezclas complejas mediante una estrategia de exploración o descubrimiento, se asienta en dos estrategias básicas, el denominado mapeo peptídico mediante espectrometría de masas y la secuenciación de péptidos mediante espectrometría de masas en tándem. Dependiendo de las características de las muestras a analizar en cada caso, resultará más óptima la utilización de equipos con características diferentes.
